Inicialment, van ser 712 els alcaldes que Fiscalia va anunciar que investigaria. Va obrir diligències per 78 d’ells per desobediència al Tribunal Constitucional i en alguns casos també per malversació, per haver cedit espais municipals per a l’organització del Referèndum. D'aquests, a 65 els han arxivat les causes; 6 han arribat a judici, amb 2 absolucions per a l’exalcaldessa de Roses i actual regidora, i l’exalcalde de Roquetes, i 4 condemnes als exalcaldes d’Alcarràs, Agramunt, Argentona i Sabadell que impliquen condemnes de multa i inhabilitació. Pels alcaldes i exalcaldes de Figueres, Collbató, Dosrius, La Ràpita, Castelló d’Empúries i Molins de Rei, la instrucció continua oberta o pendents de la celebració de judici oral en els propers mesos.